Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNPHO15079 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNPHO15079 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNPHO15079 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNPHO15079 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SNPHO15079 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNPHO15079 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNPHO15079 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNPHO15079 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNPHO15079 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNPHO15079 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNPHO15079 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNPHO15079 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNPHO15079 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNPHO15079 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNPHO15079 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNPHO15079 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SNPHO15079 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SNPHO15079 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SNPHO15079 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNPHO15079 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNPHO15079 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNPHO15079 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNPHO15079 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNPHO15079 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNPHO15079 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNPHO15079 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNPHO15079 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNPHO15079 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNPHO15079 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNPHO15079 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNPHO15079 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNPHO15079 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNPHO15079 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNPHO15079 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNPHO15079 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNPHO15079 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNPHO15079 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNPHO15079 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNPHO15079 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNPHO15079 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNPHO15079 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNPHO15079 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNPHO15079 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNPHO15079 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNPHO15079 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNPHO15079 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNPHO15079 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNPHO15079 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNPHO15079 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNPHO15079 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SNPHO15079 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNPHO15079 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNPHO15079 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNPHO15079 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNPHO15079 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNPHO15079 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNPHO15079 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNPHO15079 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNPHO15079 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNPHO15079 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNPHO15079 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SNPHO15079 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SNPHO15079 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SNPHO15079 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SNPHO15079 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SNPHO15079 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SNPHO15079 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SNPHO15079 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SNPHO15079 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SNPHO15079 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNPHO15079 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNPHO15079 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNPHO15079 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNPHO15079 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SNPHO15079 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNPHO15079 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNPHO15079 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNPHO15079 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNPHO15079 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNPHO15079 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNPHO15079 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNPHO15079 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SNPHO15079 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNPHO15079 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNPHO15079 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNPHO15079 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNPHO15079 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNPHO15079 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNPHO15079 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNPHO15079 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNPHO15079 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNPHO15079 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNPHO15079 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNPHO15079 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNPHO15079 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNPHO15079 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SNPHO15079 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SNPHO15079 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNPHO15079 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms