Protein–RNA interactions for Protein: O15020

SPTBN2, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN2O15020 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTBN2O15020 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTBN2O15020 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTBN2O15020 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTBN2O15020 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPTBN2O15020 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPTBN2O15020 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPTBN2O15020 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPTBN2O15020 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPTBN2O15020 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SPTBN2O15020 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPTBN2O15020 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPTBN2O15020 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SPTBN2O15020 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPTBN2O15020 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SPTBN2O15020 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPTBN2O15020 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPTBN2O15020 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPTBN2O15020 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPTBN2O15020 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPTBN2O15020 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPTBN2O15020 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPTBN2O15020 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPTBN2O15020 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SPTBN2O15020 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPTBN2O15020 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPTBN2O15020 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPTBN2O15020 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SPTBN2O15020 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPTBN2O15020 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPTBN2O15020 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPTBN2O15020 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPTBN2O15020 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTBN2O15020 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTBN2O15020 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTBN2O15020 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTBN2O15020 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTBN2O15020 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SPTBN2O15020 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SPTBN2O15020 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPTBN2O15020 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SPTBN2O15020 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPTBN2O15020 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPTBN2O15020 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPTBN2O15020 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPTBN2O15020 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPTBN2O15020 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPTBN2O15020 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPTBN2O15020 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPTBN2O15020 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPTBN2O15020 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPTBN2O15020 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPTBN2O15020 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPTBN2O15020 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPTBN2O15020 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SPTBN2O15020 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTBN2O15020 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTBN2O15020 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTBN2O15020 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTBN2O15020 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTBN2O15020 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTBN2O15020 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTBN2O15020 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTBN2O15020 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPTBN2O15020 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPTBN2O15020 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SPTBN2O15020 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPTBN2O15020 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPTBN2O15020 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPTBN2O15020 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPTBN2O15020 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPTBN2O15020 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SPTBN2O15020 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPTBN2O15020 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPTBN2O15020 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTBN2O15020 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTBN2O15020 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTBN2O15020 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTBN2O15020 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTBN2O15020 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTBN2O15020 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTBN2O15020 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTBN2O15020 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTBN2O15020 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPTBN2O15020 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPTBN2O15020 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPTBN2O15020 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPTBN2O15020 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPTBN2O15020 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPTBN2O15020 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPTBN2O15020 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SPTBN2O15020 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPTBN2O15020 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SPTBN2O15020 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPTBN2O15020 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SPTBN2O15020 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPTBN2O15020 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SPTBN2O15020 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPTBN2O15020 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTBN2O15020 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms