Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EBAG9O00559 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EBAG9O00559 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EBAG9O00559 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EBAG9O00559 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EBAG9O00559 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EBAG9O00559 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EBAG9O00559 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EBAG9O00559 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EBAG9O00559 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EBAG9O00559 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EBAG9O00559 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EBAG9O00559 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EBAG9O00559 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EBAG9O00559 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EBAG9O00559 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EBAG9O00559 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EBAG9O00559 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EBAG9O00559 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EBAG9O00559 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EBAG9O00559 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EBAG9O00559 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EBAG9O00559 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EBAG9O00559 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EBAG9O00559 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EBAG9O00559 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EBAG9O00559 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EBAG9O00559 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EBAG9O00559 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EBAG9O00559 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EBAG9O00559 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EBAG9O00559 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EBAG9O00559 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EBAG9O00559 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EBAG9O00559 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EBAG9O00559 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EBAG9O00559 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EBAG9O00559 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EBAG9O00559 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EBAG9O00559 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EBAG9O00559 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EBAG9O00559 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EBAG9O00559 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EBAG9O00559 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EBAG9O00559 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EBAG9O00559 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EBAG9O00559 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EBAG9O00559 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EBAG9O00559 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EBAG9O00559 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EBAG9O00559 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EBAG9O00559 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EBAG9O00559 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EBAG9O00559 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EBAG9O00559 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EBAG9O00559 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EBAG9O00559 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EBAG9O00559 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EBAG9O00559 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EBAG9O00559 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EBAG9O00559 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EBAG9O00559 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EBAG9O00559 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EBAG9O00559 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EBAG9O00559 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EBAG9O00559 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EBAG9O00559 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EBAG9O00559 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EBAG9O00559 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
EBAG9O00559 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EBAG9O00559 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EBAG9O00559 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EBAG9O00559 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EBAG9O00559 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EBAG9O00559 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EBAG9O00559 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EBAG9O00559 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EBAG9O00559 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EBAG9O00559 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EBAG9O00559 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EBAG9O00559 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EBAG9O00559 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EBAG9O00559 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EBAG9O00559 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EBAG9O00559 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EBAG9O00559 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EBAG9O00559 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EBAG9O00559 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EBAG9O00559 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EBAG9O00559 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EBAG9O00559 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EBAG9O00559 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EBAG9O00559 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EBAG9O00559 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EBAG9O00559 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EBAG9O00559 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EBAG9O00559 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EBAG9O00559 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EBAG9O00559 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EBAG9O00559 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms