Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KPNA3O00505 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KPNA3O00505 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KPNA3O00505 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KPNA3O00505 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KPNA3O00505 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KPNA3O00505 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KPNA3O00505 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KPNA3O00505 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KPNA3O00505 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KPNA3O00505 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KPNA3O00505 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KPNA3O00505 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KPNA3O00505 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KPNA3O00505 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KPNA3O00505 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KPNA3O00505 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KPNA3O00505 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KPNA3O00505 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KPNA3O00505 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KPNA3O00505 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KPNA3O00505 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KPNA3O00505 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KPNA3O00505 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KPNA3O00505 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KPNA3O00505 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KPNA3O00505 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KPNA3O00505 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KPNA3O00505 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KPNA3O00505 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KPNA3O00505 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KPNA3O00505 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KPNA3O00505 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KPNA3O00505 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KPNA3O00505 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KPNA3O00505 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KPNA3O00505 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KPNA3O00505 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KPNA3O00505 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KPNA3O00505 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KPNA3O00505 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KPNA3O00505 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KPNA3O00505 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KPNA3O00505 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KPNA3O00505 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KPNA3O00505 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KPNA3O00505 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KPNA3O00505 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KPNA3O00505 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KPNA3O00505 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KPNA3O00505 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KPNA3O00505 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KPNA3O00505 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KPNA3O00505 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KPNA3O00505 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KPNA3O00505 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KPNA3O00505 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KPNA3O00505 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KPNA3O00505 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KPNA3O00505 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KPNA3O00505 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KPNA3O00505 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KPNA3O00505 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KPNA3O00505 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KPNA3O00505 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KPNA3O00505 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KPNA3O00505 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KPNA3O00505 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KPNA3O00505 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KPNA3O00505 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KPNA3O00505 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KPNA3O00505 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KPNA3O00505 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KPNA3O00505 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KPNA3O00505 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KPNA3O00505 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KPNA3O00505 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KPNA3O00505 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KPNA3O00505 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KPNA3O00505 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KPNA3O00505 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KPNA3O00505 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KPNA3O00505 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KPNA3O00505 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KPNA3O00505 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KPNA3O00505 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KPNA3O00505 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KPNA3O00505 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KPNA3O00505 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KPNA3O00505 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KPNA3O00505 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KPNA3O00505 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KPNA3O00505 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KPNA3O00505 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KPNA3O00505 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KPNA3O00505 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KPNA3O00505 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KPNA3O00505 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KPNA3O00505 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KPNA3O00505 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms