Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCER2I3L3R5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCER2I3L3R5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCER2I3L3R5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCER2I3L3R5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCER2I3L3R5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCER2I3L3R5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCER2I3L3R5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCER2I3L3R5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCER2I3L3R5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCER2I3L3R5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCER2I3L3R5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
CCER2I3L3R5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCER2I3L3R5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCER2I3L3R5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CCER2I3L3R5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CCER2I3L3R5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCER2I3L3R5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCER2I3L3R5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCER2I3L3R5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCER2I3L3R5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCER2I3L3R5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCER2I3L3R5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCER2I3L3R5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCER2I3L3R5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCER2I3L3R5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCER2I3L3R5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCER2I3L3R5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CCER2I3L3R5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CCER2I3L3R5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCER2I3L3R5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCER2I3L3R5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCER2I3L3R5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCER2I3L3R5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCER2I3L3R5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCER2I3L3R5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCER2I3L3R5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCER2I3L3R5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CCER2I3L3R5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CCER2I3L3R5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CCER2I3L3R5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CCER2I3L3R5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CCER2I3L3R5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CCER2I3L3R5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CCER2I3L3R5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CCER2I3L3R5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
CCER2I3L3R5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCER2I3L3R5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCER2I3L3R5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCER2I3L3R5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCER2I3L3R5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCER2I3L3R5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCER2I3L3R5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCER2I3L3R5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CCER2I3L3R5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CCER2I3L3R5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CCER2I3L3R5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CCER2I3L3R5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CCER2I3L3R5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CCER2I3L3R5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CCER2I3L3R5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCER2I3L3R5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCER2I3L3R5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCER2I3L3R5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCER2I3L3R5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CCER2I3L3R5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CCER2I3L3R5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CCER2I3L3R5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CCER2I3L3R5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CCER2I3L3R5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CCER2I3L3R5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CCER2I3L3R5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CCER2I3L3R5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
CCER2I3L3R5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCER2I3L3R5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCER2I3L3R5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCER2I3L3R5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCER2I3L3R5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCER2I3L3R5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCER2I3L3R5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCER2I3L3R5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CCER2I3L3R5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCER2I3L3R5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
CCER2I3L3R5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
CCER2I3L3R5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
CCER2I3L3R5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
CCER2I3L3R5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCER2I3L3R5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCER2I3L3R5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCER2I3L3R5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
CCER2I3L3R5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
CCER2I3L3R5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCER2I3L3R5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCER2I3L3R5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
CCER2I3L3R5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCER2I3L3R5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCER2I3L3R5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCER2I3L3R5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCER2I3L3R5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
CCER2I3L3R5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms