Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms