Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BNH8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
H3BNH8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H3BNH8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BNH8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BNH8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BNH8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BNH8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BNH8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BNH8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BNH8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BNH8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BNH8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BNH8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BNH8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BNH8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BNH8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BNH8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BNH8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BNH8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BNH8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BNH8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BNH8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BNH8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BNH8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BNH8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BNH8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BNH8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BNH8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BNH8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
H3BNH8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H3BNH8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H3BNH8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
H3BNH8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
H3BNH8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H3BNH8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H3BNH8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3BNH8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3BNH8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3BNH8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3BNH8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3BNH8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3BNH8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3BNH8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
H3BNH8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H3BNH8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H3BNH8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
H3BNH8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
H3BNH8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
H3BNH8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
H3BNH8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
H3BNH8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
H3BNH8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H3BNH8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3BNH8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3BNH8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3BNH8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
H3BNH8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H3BNH8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H3BNH8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
H3BNH8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
H3BNH8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
H3BNH8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H3BNH8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
H3BNH8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H3BNH8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H3BNH8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
H3BNH8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
H3BNH8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
H3BNH8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
H3BNH8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H3BNH8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
H3BNH8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H3BNH8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H3BNH8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
H3BNH8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H3BNH8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H3BNH8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
H3BNH8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H3BNH8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
H3BNH8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
H3BNH8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
H3BNH8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
H3BNH8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
H3BNH8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
H3BNH8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BNH8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BNH8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BNH8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BNH8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H3BNH8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
H3BNH8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H3BNH8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
H3BNH8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H3BNH8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
H3BNH8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
H3BNH8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H3BNH8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H3BNH8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H3BNH8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms