Protein–RNA interactions for Protein: H3BMG3

SMKR1, Small lysine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1H3BMG3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMKR1H3BMG3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMKR1H3BMG3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMKR1H3BMG3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMKR1H3BMG3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMKR1H3BMG3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMKR1H3BMG3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMKR1H3BMG3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMKR1H3BMG3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMKR1H3BMG3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMKR1H3BMG3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMKR1H3BMG3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMKR1H3BMG3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMKR1H3BMG3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMKR1H3BMG3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMKR1H3BMG3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMKR1H3BMG3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMKR1H3BMG3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMKR1H3BMG3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMKR1H3BMG3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMKR1H3BMG3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMKR1H3BMG3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMKR1H3BMG3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMKR1H3BMG3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMKR1H3BMG3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMKR1H3BMG3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMKR1H3BMG3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMKR1H3BMG3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMKR1H3BMG3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMKR1H3BMG3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMKR1H3BMG3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMKR1H3BMG3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMKR1H3BMG3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMKR1H3BMG3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMKR1H3BMG3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMKR1H3BMG3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMKR1H3BMG3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMKR1H3BMG3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMKR1H3BMG3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMKR1H3BMG3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMKR1H3BMG3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMKR1H3BMG3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMKR1H3BMG3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMKR1H3BMG3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMKR1H3BMG3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMKR1H3BMG3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMKR1H3BMG3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMKR1H3BMG3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMKR1H3BMG3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMKR1H3BMG3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMKR1H3BMG3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SMKR1H3BMG3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMKR1H3BMG3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMKR1H3BMG3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMKR1H3BMG3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMKR1H3BMG3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMKR1H3BMG3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMKR1H3BMG3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMKR1H3BMG3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMKR1H3BMG3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMKR1H3BMG3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SMKR1H3BMG3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMKR1H3BMG3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SMKR1H3BMG3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMKR1H3BMG3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMKR1H3BMG3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMKR1H3BMG3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMKR1H3BMG3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMKR1H3BMG3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMKR1H3BMG3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMKR1H3BMG3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMKR1H3BMG3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMKR1H3BMG3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMKR1H3BMG3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMKR1H3BMG3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMKR1H3BMG3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMKR1H3BMG3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMKR1H3BMG3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMKR1H3BMG3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMKR1H3BMG3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMKR1H3BMG3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMKR1H3BMG3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMKR1H3BMG3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMKR1H3BMG3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMKR1H3BMG3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMKR1H3BMG3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMKR1H3BMG3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMKR1H3BMG3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMKR1H3BMG3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMKR1H3BMG3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMKR1H3BMG3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMKR1H3BMG3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMKR1H3BMG3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMKR1H3BMG3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMKR1H3BMG3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMKR1H3BMG3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMKR1H3BMG3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMKR1H3BMG3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMKR1H3BMG3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMKR1H3BMG3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 204.4 ms