Protein–RNA interactions for Protein: H3BM21

Integrin beta (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BM21 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
H3BM21 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H3BM21 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
H3BM21 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
H3BM21 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H3BM21 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H3BM21 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H3BM21 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
H3BM21 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
H3BM21 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
H3BM21 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H3BM21 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H3BM21 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
H3BM21 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
H3BM21 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
H3BM21 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
H3BM21 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H3BM21 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H3BM21 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H3BM21 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
H3BM21 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
H3BM21 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
H3BM21 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H3BM21 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H3BM21 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H3BM21 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H3BM21 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
H3BM21 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H3BM21 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H3BM21 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H3BM21 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H3BM21 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H3BM21 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H3BM21 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H3BM21 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H3BM21 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H3BM21 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H3BM21 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
H3BM21 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
H3BM21 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H3BM21 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H3BM21 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H3BM21 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H3BM21 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H3BM21 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
H3BM21 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H3BM21 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H3BM21 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H3BM21 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
H3BM21 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
H3BM21 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
H3BM21 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
H3BM21 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
H3BM21 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
H3BM21 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
H3BM21 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
H3BM21 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H3BM21 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H3BM21 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
H3BM21 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H3BM21 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BM21 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BM21 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BM21 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BM21 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BM21 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BM21 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BM21 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
H3BM21 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H3BM21 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H3BM21 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
H3BM21 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
H3BM21 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
H3BM21 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
H3BM21 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
H3BM21 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H3BM21 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
H3BM21 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H3BM21 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H3BM21 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
H3BM21 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
H3BM21 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
H3BM21 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
H3BM21 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
H3BM21 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
H3BM21 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BM21 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BM21 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BM21 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BM21 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BM21 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BM21 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BM21 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BM21 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BM21 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BM21 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BM21 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BM21 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BM21 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BM21 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms