Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEDD8-MDP1E9PL57 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEDD8-MDP1E9PL57 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEDD8-MDP1E9PL57 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEDD8-MDP1E9PL57 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1E9PL57 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1E9PL57 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1E9PL57 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1E9PL57 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1E9PL57 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1E9PL57 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1E9PL57 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1E9PL57 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1E9PL57 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1E9PL57 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1E9PL57 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1E9PL57 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1E9PL57 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1E9PL57 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1E9PL57 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1E9PL57 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1E9PL57 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1E9PL57 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1E9PL57 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1E9PL57 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1E9PL57 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1E9PL57 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NEDD8-MDP1E9PL57 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEDD8-MDP1E9PL57 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEDD8-MDP1E9PL57 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NEDD8-MDP1E9PL57 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEDD8-MDP1E9PL57 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NEDD8-MDP1E9PL57 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEDD8-MDP1E9PL57 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEDD8-MDP1E9PL57 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NEDD8-MDP1E9PL57 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NEDD8-MDP1E9PL57 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEDD8-MDP1E9PL57 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEDD8-MDP1E9PL57 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEDD8-MDP1E9PL57 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEDD8-MDP1E9PL57 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEDD8-MDP1E9PL57 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEDD8-MDP1E9PL57 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEDD8-MDP1E9PL57 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD8-MDP1E9PL57 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD8-MDP1E9PL57 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD8-MDP1E9PL57 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD8-MDP1E9PL57 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD8-MDP1E9PL57 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD8-MDP1E9PL57 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD8-MDP1E9PL57 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD8-MDP1E9PL57 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NEDD8-MDP1E9PL57 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEDD8-MDP1E9PL57 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NEDD8-MDP1E9PL57 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEDD8-MDP1E9PL57 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NEDD8-MDP1E9PL57 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEDD8-MDP1E9PL57 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEDD8-MDP1E9PL57 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
NEDD8-MDP1E9PL57 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEDD8-MDP1E9PL57 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEDD8-MDP1E9PL57 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEDD8-MDP1E9PL57 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEDD8-MDP1E9PL57 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEDD8-MDP1E9PL57 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEDD8-MDP1E9PL57 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEDD8-MDP1E9PL57 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEDD8-MDP1E9PL57 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEDD8-MDP1E9PL57 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEDD8-MDP1E9PL57 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms