Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF879B4DU55 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF879B4DU55 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF879B4DU55 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF879B4DU55 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF879B4DU55 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF879B4DU55 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF879B4DU55 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF879B4DU55 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF879B4DU55 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF879B4DU55 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF879B4DU55 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF879B4DU55 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF879B4DU55 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF879B4DU55 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF879B4DU55 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF879B4DU55 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF879B4DU55 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF879B4DU55 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF879B4DU55 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF879B4DU55 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF879B4DU55 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF879B4DU55 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF879B4DU55 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF879B4DU55 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF879B4DU55 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF879B4DU55 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF879B4DU55 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF879B4DU55 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF879B4DU55 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF879B4DU55 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF879B4DU55 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF879B4DU55 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF879B4DU55 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF879B4DU55 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF879B4DU55 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF879B4DU55 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF879B4DU55 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF879B4DU55 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF879B4DU55 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF879B4DU55 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF879B4DU55 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF879B4DU55 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF879B4DU55 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF879B4DU55 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF879B4DU55 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF879B4DU55 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF879B4DU55 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF879B4DU55 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF879B4DU55 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF879B4DU55 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF879B4DU55 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF879B4DU55 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF879B4DU55 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF879B4DU55 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF879B4DU55 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF879B4DU55 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF879B4DU55 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF879B4DU55 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF879B4DU55 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF879B4DU55 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF879B4DU55 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF879B4DU55 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF879B4DU55 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZNF879B4DU55 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF879B4DU55 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF879B4DU55 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF879B4DU55 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF879B4DU55 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF879B4DU55 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF879B4DU55 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF879B4DU55 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF879B4DU55 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF879B4DU55 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF879B4DU55 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF879B4DU55 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF879B4DU55 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF879B4DU55 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF879B4DU55 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF879B4DU55 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF879B4DU55 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF879B4DU55 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF879B4DU55 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF879B4DU55 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF879B4DU55 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF879B4DU55 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF879B4DU55 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF879B4DU55 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF879B4DU55 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF879B4DU55 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF879B4DU55 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF879B4DU55 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF879B4DU55 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF879B4DU55 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF879B4DU55 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF879B4DU55 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF879B4DU55 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF879B4DU55 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF879B4DU55 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF879B4DU55 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms