Protein–RNA interactions for Protein: A9Z1Z3

FER1L4, Fer-1-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FER1L4A9Z1Z3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
FER1L4A9Z1Z3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
FER1L4A9Z1Z3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
FER1L4A9Z1Z3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
FER1L4A9Z1Z3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC38.25■■■■□ 3.71
FER1L4A9Z1Z3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
FER1L4A9Z1Z3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
FER1L4A9Z1Z3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
FER1L4A9Z1Z3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
FER1L4A9Z1Z3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
FER1L4A9Z1Z3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
FER1L4A9Z1Z3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
FER1L4A9Z1Z3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
FER1L4A9Z1Z3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
FER1L4A9Z1Z3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
FER1L4A9Z1Z3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
FER1L4A9Z1Z3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
FER1L4A9Z1Z3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
FER1L4A9Z1Z3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
FER1L4A9Z1Z3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
FER1L4A9Z1Z3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
FER1L4A9Z1Z3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
FER1L4A9Z1Z3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
FER1L4A9Z1Z3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
FER1L4A9Z1Z3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
FER1L4A9Z1Z3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
FER1L4A9Z1Z3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
FER1L4A9Z1Z3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
FER1L4A9Z1Z3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
FER1L4A9Z1Z3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
FER1L4A9Z1Z3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
FER1L4A9Z1Z3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
FER1L4A9Z1Z3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
FER1L4A9Z1Z3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
FER1L4A9Z1Z3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
FER1L4A9Z1Z3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
FER1L4A9Z1Z3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
FER1L4A9Z1Z3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
FER1L4A9Z1Z3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
FER1L4A9Z1Z3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
FER1L4A9Z1Z3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
FER1L4A9Z1Z3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
FER1L4A9Z1Z3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
FER1L4A9Z1Z3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
FER1L4A9Z1Z3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
FER1L4A9Z1Z3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
FER1L4A9Z1Z3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
FER1L4A9Z1Z3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
FER1L4A9Z1Z3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
FER1L4A9Z1Z3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
FER1L4A9Z1Z3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
FER1L4A9Z1Z3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
FER1L4A9Z1Z3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
FER1L4A9Z1Z3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
FER1L4A9Z1Z3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
FER1L4A9Z1Z3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
FER1L4A9Z1Z3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
FER1L4A9Z1Z3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
FER1L4A9Z1Z3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
FER1L4A9Z1Z3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
FER1L4A9Z1Z3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
FER1L4A9Z1Z3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
FER1L4A9Z1Z3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
FER1L4A9Z1Z3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
FER1L4A9Z1Z3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
FER1L4A9Z1Z3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
FER1L4A9Z1Z3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
FER1L4A9Z1Z3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
FER1L4A9Z1Z3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
FER1L4A9Z1Z3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
FER1L4A9Z1Z3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
FER1L4A9Z1Z3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
FER1L4A9Z1Z3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
FER1L4A9Z1Z3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
FER1L4A9Z1Z3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
FER1L4A9Z1Z3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
FER1L4A9Z1Z3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
FER1L4A9Z1Z3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
FER1L4A9Z1Z3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
FER1L4A9Z1Z3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
FER1L4A9Z1Z3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
FER1L4A9Z1Z3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
FER1L4A9Z1Z3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
FER1L4A9Z1Z3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
FER1L4A9Z1Z3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
FER1L4A9Z1Z3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
FER1L4A9Z1Z3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC38■■■■□ 3.67
FER1L4A9Z1Z3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
FER1L4A9Z1Z3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
FER1L4A9Z1Z3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
FER1L4A9Z1Z3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
FER1L4A9Z1Z3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
FER1L4A9Z1Z3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
FER1L4A9Z1Z3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
FER1L4A9Z1Z3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
FER1L4A9Z1Z3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
FER1L4A9Z1Z3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
FER1L4A9Z1Z3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
FER1L4A9Z1Z3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
FER1L4A9Z1Z3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms