Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOTOA8MTQ0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOTOA8MTQ0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NOTOA8MTQ0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOTOA8MTQ0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOTOA8MTQ0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOTOA8MTQ0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOTOA8MTQ0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOTOA8MTQ0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOTOA8MTQ0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOTOA8MTQ0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOTOA8MTQ0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOTOA8MTQ0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOTOA8MTQ0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOTOA8MTQ0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOTOA8MTQ0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOTOA8MTQ0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOTOA8MTQ0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOTOA8MTQ0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOTOA8MTQ0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOTOA8MTQ0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOTOA8MTQ0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOTOA8MTQ0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NOTOA8MTQ0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOTOA8MTQ0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOTOA8MTQ0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOTOA8MTQ0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOTOA8MTQ0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOTOA8MTQ0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOTOA8MTQ0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOTOA8MTQ0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOTOA8MTQ0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NOTOA8MTQ0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOTOA8MTQ0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOTOA8MTQ0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOTOA8MTQ0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOTOA8MTQ0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOTOA8MTQ0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOTOA8MTQ0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOTOA8MTQ0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOTOA8MTQ0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOTOA8MTQ0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOTOA8MTQ0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOTOA8MTQ0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOTOA8MTQ0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NOTOA8MTQ0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOTOA8MTQ0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOTOA8MTQ0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOTOA8MTQ0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOTOA8MTQ0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOTOA8MTQ0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOTOA8MTQ0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOTOA8MTQ0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOTOA8MTQ0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOTOA8MTQ0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOTOA8MTQ0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOTOA8MTQ0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOTOA8MTQ0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOTOA8MTQ0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOTOA8MTQ0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOTOA8MTQ0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOTOA8MTQ0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOTOA8MTQ0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOTOA8MTQ0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOTOA8MTQ0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOTOA8MTQ0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOTOA8MTQ0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NOTOA8MTQ0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NOTOA8MTQ0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOTOA8MTQ0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOTOA8MTQ0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOTOA8MTQ0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOTOA8MTQ0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOTOA8MTQ0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOTOA8MTQ0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOTOA8MTQ0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOTOA8MTQ0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOTOA8MTQ0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NOTOA8MTQ0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NOTOA8MTQ0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOTOA8MTQ0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOTOA8MTQ0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOTOA8MTQ0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOTOA8MTQ0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOTOA8MTQ0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOTOA8MTQ0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOTOA8MTQ0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOTOA8MTQ0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOTOA8MTQ0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOTOA8MTQ0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOTOA8MTQ0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOTOA8MTQ0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOTOA8MTQ0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOTOA8MTQ0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOTOA8MTQ0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOTOA8MTQ0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOTOA8MTQ0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOTOA8MTQ0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOTOA8MTQ0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOTOA8MTQ0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms