Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP27XA6NNY8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
USP27XA6NNY8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP27XA6NNY8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP27XA6NNY8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP27XA6NNY8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP27XA6NNY8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP27XA6NNY8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP27XA6NNY8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
USP27XA6NNY8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP27XA6NNY8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP27XA6NNY8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP27XA6NNY8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP27XA6NNY8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP27XA6NNY8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP27XA6NNY8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP27XA6NNY8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP27XA6NNY8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP27XA6NNY8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP27XA6NNY8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP27XA6NNY8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP27XA6NNY8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP27XA6NNY8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP27XA6NNY8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP27XA6NNY8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP27XA6NNY8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP27XA6NNY8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP27XA6NNY8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP27XA6NNY8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP27XA6NNY8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP27XA6NNY8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP27XA6NNY8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
USP27XA6NNY8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP27XA6NNY8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP27XA6NNY8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP27XA6NNY8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP27XA6NNY8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP27XA6NNY8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP27XA6NNY8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
USP27XA6NNY8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP27XA6NNY8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP27XA6NNY8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP27XA6NNY8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP27XA6NNY8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP27XA6NNY8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP27XA6NNY8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP27XA6NNY8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP27XA6NNY8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP27XA6NNY8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP27XA6NNY8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP27XA6NNY8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP27XA6NNY8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP27XA6NNY8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP27XA6NNY8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP27XA6NNY8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP27XA6NNY8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP27XA6NNY8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP27XA6NNY8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP27XA6NNY8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
USP27XA6NNY8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP27XA6NNY8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP27XA6NNY8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP27XA6NNY8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP27XA6NNY8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP27XA6NNY8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP27XA6NNY8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP27XA6NNY8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
USP27XA6NNY8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP27XA6NNY8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP27XA6NNY8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP27XA6NNY8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP27XA6NNY8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP27XA6NNY8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP27XA6NNY8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP27XA6NNY8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP27XA6NNY8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP27XA6NNY8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP27XA6NNY8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP27XA6NNY8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP27XA6NNY8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP27XA6NNY8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP27XA6NNY8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP27XA6NNY8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP27XA6NNY8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP27XA6NNY8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP27XA6NNY8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP27XA6NNY8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP27XA6NNY8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP27XA6NNY8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP27XA6NNY8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP27XA6NNY8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP27XA6NNY8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP27XA6NNY8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP27XA6NNY8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP27XA6NNY8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP27XA6NNY8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP27XA6NNY8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP27XA6NNY8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP27XA6NNY8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP27XA6NNY8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.2 ms