Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC0

FAM90A7P, Putative protein FAM90A7P, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM90A7PA6NKC0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM90A7PA6NKC0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM90A7PA6NKC0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM90A7PA6NKC0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM90A7PA6NKC0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM90A7PA6NKC0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM90A7PA6NKC0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM90A7PA6NKC0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM90A7PA6NKC0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM90A7PA6NKC0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM90A7PA6NKC0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM90A7PA6NKC0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM90A7PA6NKC0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM90A7PA6NKC0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM90A7PA6NKC0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM90A7PA6NKC0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM90A7PA6NKC0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM90A7PA6NKC0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM90A7PA6NKC0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM90A7PA6NKC0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM90A7PA6NKC0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM90A7PA6NKC0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM90A7PA6NKC0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM90A7PA6NKC0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM90A7PA6NKC0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM90A7PA6NKC0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM90A7PA6NKC0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM90A7PA6NKC0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM90A7PA6NKC0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM90A7PA6NKC0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM90A7PA6NKC0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM90A7PA6NKC0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM90A7PA6NKC0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM90A7PA6NKC0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM90A7PA6NKC0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM90A7PA6NKC0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM90A7PA6NKC0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM90A7PA6NKC0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM90A7PA6NKC0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM90A7PA6NKC0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM90A7PA6NKC0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM90A7PA6NKC0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM90A7PA6NKC0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM90A7PA6NKC0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM90A7PA6NKC0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM90A7PA6NKC0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM90A7PA6NKC0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM90A7PA6NKC0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM90A7PA6NKC0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM90A7PA6NKC0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM90A7PA6NKC0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM90A7PA6NKC0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM90A7PA6NKC0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM90A7PA6NKC0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM90A7PA6NKC0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM90A7PA6NKC0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FAM90A7PA6NKC0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM90A7PA6NKC0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM90A7PA6NKC0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM90A7PA6NKC0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM90A7PA6NKC0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM90A7PA6NKC0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM90A7PA6NKC0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM90A7PA6NKC0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM90A7PA6NKC0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM90A7PA6NKC0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM90A7PA6NKC0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM90A7PA6NKC0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM90A7PA6NKC0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM90A7PA6NKC0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM90A7PA6NKC0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM90A7PA6NKC0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM90A7PA6NKC0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM90A7PA6NKC0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM90A7PA6NKC0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM90A7PA6NKC0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM90A7PA6NKC0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM90A7PA6NKC0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM90A7PA6NKC0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM90A7PA6NKC0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM90A7PA6NKC0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM90A7PA6NKC0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM90A7PA6NKC0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM90A7PA6NKC0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM90A7PA6NKC0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM90A7PA6NKC0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM90A7PA6NKC0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
FAM90A7PA6NKC0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM90A7PA6NKC0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM90A7PA6NKC0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM90A7PA6NKC0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM90A7PA6NKC0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM90A7PA6NKC0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM90A7PA6NKC0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM90A7PA6NKC0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM90A7PA6NKC0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM90A7PA6NKC0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM90A7PA6NKC0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM90A7PA6NKC0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM90A7PA6NKC0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms