Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCNX2A6NKB5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCNX2A6NKB5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCNX2A6NKB5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCNX2A6NKB5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCNX2A6NKB5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCNX2A6NKB5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCNX2A6NKB5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCNX2A6NKB5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCNX2A6NKB5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCNX2A6NKB5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCNX2A6NKB5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCNX2A6NKB5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCNX2A6NKB5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCNX2A6NKB5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCNX2A6NKB5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCNX2A6NKB5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCNX2A6NKB5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCNX2A6NKB5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCNX2A6NKB5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCNX2A6NKB5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCNX2A6NKB5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PCNX2A6NKB5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCNX2A6NKB5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCNX2A6NKB5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCNX2A6NKB5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCNX2A6NKB5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCNX2A6NKB5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCNX2A6NKB5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PCNX2A6NKB5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCNX2A6NKB5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCNX2A6NKB5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCNX2A6NKB5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCNX2A6NKB5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCNX2A6NKB5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCNX2A6NKB5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCNX2A6NKB5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCNX2A6NKB5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCNX2A6NKB5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCNX2A6NKB5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCNX2A6NKB5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCNX2A6NKB5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCNX2A6NKB5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PCNX2A6NKB5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCNX2A6NKB5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCNX2A6NKB5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCNX2A6NKB5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCNX2A6NKB5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCNX2A6NKB5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCNX2A6NKB5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCNX2A6NKB5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCNX2A6NKB5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PCNX2A6NKB5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCNX2A6NKB5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCNX2A6NKB5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PCNX2A6NKB5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCNX2A6NKB5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCNX2A6NKB5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCNX2A6NKB5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCNX2A6NKB5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCNX2A6NKB5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCNX2A6NKB5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCNX2A6NKB5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCNX2A6NKB5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCNX2A6NKB5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCNX2A6NKB5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCNX2A6NKB5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCNX2A6NKB5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCNX2A6NKB5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PCNX2A6NKB5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCNX2A6NKB5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PCNX2A6NKB5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCNX2A6NKB5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCNX2A6NKB5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PCNX2A6NKB5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCNX2A6NKB5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCNX2A6NKB5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCNX2A6NKB5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCNX2A6NKB5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCNX2A6NKB5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCNX2A6NKB5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCNX2A6NKB5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCNX2A6NKB5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCNX2A6NKB5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCNX2A6NKB5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCNX2A6NKB5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PCNX2A6NKB5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCNX2A6NKB5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCNX2A6NKB5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCNX2A6NKB5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCNX2A6NKB5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCNX2A6NKB5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCNX2A6NKB5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCNX2A6NKB5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCNX2A6NKB5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCNX2A6NKB5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PCNX2A6NKB5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCNX2A6NKB5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCNX2A6NKB5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCNX2A6NKB5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms