Protein–RNA interactions for Protein: A6NHC0

CAPN8, Calpain-8, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN8A6NHC0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN8A6NHC0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN8A6NHC0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN8A6NHC0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN8A6NHC0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN8A6NHC0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN8A6NHC0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN8A6NHC0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN8A6NHC0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN8A6NHC0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN8A6NHC0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN8A6NHC0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN8A6NHC0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN8A6NHC0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN8A6NHC0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPN8A6NHC0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPN8A6NHC0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPN8A6NHC0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPN8A6NHC0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CAPN8A6NHC0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN8A6NHC0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN8A6NHC0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN8A6NHC0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN8A6NHC0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN8A6NHC0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPN8A6NHC0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPN8A6NHC0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN8A6NHC0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN8A6NHC0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN8A6NHC0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN8A6NHC0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN8A6NHC0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN8A6NHC0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN8A6NHC0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN8A6NHC0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN8A6NHC0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN8A6NHC0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN8A6NHC0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN8A6NHC0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN8A6NHC0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN8A6NHC0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN8A6NHC0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN8A6NHC0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN8A6NHC0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN8A6NHC0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN8A6NHC0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN8A6NHC0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN8A6NHC0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN8A6NHC0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN8A6NHC0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN8A6NHC0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN8A6NHC0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN8A6NHC0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN8A6NHC0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN8A6NHC0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN8A6NHC0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN8A6NHC0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN8A6NHC0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN8A6NHC0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN8A6NHC0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN8A6NHC0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN8A6NHC0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN8A6NHC0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN8A6NHC0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN8A6NHC0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN8A6NHC0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN8A6NHC0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN8A6NHC0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN8A6NHC0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN8A6NHC0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN8A6NHC0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN8A6NHC0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN8A6NHC0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN8A6NHC0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN8A6NHC0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN8A6NHC0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN8A6NHC0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN8A6NHC0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN8A6NHC0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN8A6NHC0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN8A6NHC0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN8A6NHC0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN8A6NHC0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN8A6NHC0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN8A6NHC0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN8A6NHC0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN8A6NHC0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN8A6NHC0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN8A6NHC0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN8A6NHC0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN8A6NHC0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN8A6NHC0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN8A6NHC0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN8A6NHC0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN8A6NHC0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN8A6NHC0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN8A6NHC0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN8A6NHC0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN8A6NHC0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CAPN8A6NHC0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms