Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT87PA6NCN2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT87PA6NCN2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT87PA6NCN2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT87PA6NCN2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT87PA6NCN2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT87PA6NCN2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT87PA6NCN2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT87PA6NCN2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT87PA6NCN2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT87PA6NCN2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT87PA6NCN2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT87PA6NCN2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT87PA6NCN2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT87PA6NCN2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT87PA6NCN2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT87PA6NCN2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT87PA6NCN2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT87PA6NCN2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT87PA6NCN2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT87PA6NCN2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT87PA6NCN2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT87PA6NCN2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT87PA6NCN2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT87PA6NCN2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT87PA6NCN2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT87PA6NCN2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT87PA6NCN2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT87PA6NCN2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT87PA6NCN2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT87PA6NCN2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT87PA6NCN2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT87PA6NCN2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT87PA6NCN2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT87PA6NCN2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT87PA6NCN2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT87PA6NCN2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT87PA6NCN2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT87PA6NCN2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT87PA6NCN2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT87PA6NCN2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT87PA6NCN2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT87PA6NCN2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT87PA6NCN2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT87PA6NCN2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT87PA6NCN2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT87PA6NCN2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT87PA6NCN2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT87PA6NCN2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT87PA6NCN2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT87PA6NCN2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT87PA6NCN2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT87PA6NCN2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT87PA6NCN2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT87PA6NCN2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT87PA6NCN2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT87PA6NCN2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT87PA6NCN2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT87PA6NCN2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT87PA6NCN2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT87PA6NCN2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT87PA6NCN2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT87PA6NCN2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT87PA6NCN2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT87PA6NCN2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT87PA6NCN2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT87PA6NCN2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT87PA6NCN2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT87PA6NCN2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT87PA6NCN2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT87PA6NCN2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT87PA6NCN2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT87PA6NCN2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT87PA6NCN2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT87PA6NCN2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT87PA6NCN2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT87PA6NCN2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT87PA6NCN2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT87PA6NCN2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT87PA6NCN2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT87PA6NCN2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT87PA6NCN2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT87PA6NCN2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT87PA6NCN2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT87PA6NCN2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT87PA6NCN2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT87PA6NCN2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT87PA6NCN2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT87PA6NCN2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT87PA6NCN2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT87PA6NCN2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT87PA6NCN2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT87PA6NCN2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT87PA6NCN2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT87PA6NCN2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT87PA6NCN2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT87PA6NCN2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT87PA6NCN2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT87PA6NCN2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT87PA6NCN2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms