Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM89A2RUT3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM89A2RUT3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM89A2RUT3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM89A2RUT3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM89A2RUT3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM89A2RUT3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM89A2RUT3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM89A2RUT3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM89A2RUT3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM89A2RUT3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM89A2RUT3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM89A2RUT3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM89A2RUT3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM89A2RUT3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM89A2RUT3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM89A2RUT3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM89A2RUT3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM89A2RUT3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM89A2RUT3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM89A2RUT3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM89A2RUT3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM89A2RUT3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM89A2RUT3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM89A2RUT3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM89A2RUT3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM89A2RUT3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM89A2RUT3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM89A2RUT3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM89A2RUT3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM89A2RUT3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM89A2RUT3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM89A2RUT3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM89A2RUT3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM89A2RUT3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM89A2RUT3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM89A2RUT3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM89A2RUT3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM89A2RUT3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM89A2RUT3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM89A2RUT3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM89A2RUT3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM89A2RUT3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM89A2RUT3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM89A2RUT3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM89A2RUT3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM89A2RUT3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM89A2RUT3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM89A2RUT3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM89A2RUT3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM89A2RUT3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM89A2RUT3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM89A2RUT3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM89A2RUT3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM89A2RUT3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM89A2RUT3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM89A2RUT3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM89A2RUT3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM89A2RUT3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM89A2RUT3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM89A2RUT3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM89A2RUT3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM89A2RUT3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM89A2RUT3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM89A2RUT3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM89A2RUT3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM89A2RUT3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM89A2RUT3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM89A2RUT3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM89A2RUT3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM89A2RUT3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM89A2RUT3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM89A2RUT3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM89A2RUT3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM89A2RUT3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM89A2RUT3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM89A2RUT3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM89A2RUT3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM89A2RUT3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM89A2RUT3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM89A2RUT3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM89A2RUT3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM89A2RUT3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM89A2RUT3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM89A2RUT3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM89A2RUT3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM89A2RUT3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM89A2RUT3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM89A2RUT3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM89A2RUT3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM89A2RUT3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM89A2RUT3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM89A2RUT3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM89A2RUT3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM89A2RUT3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM89A2RUT3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM89A2RUT3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM89A2RUT3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM89A2RUT3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM89A2RUT3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms