Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWF9

TRBV2, T-cell receptor beta variable 2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV2A0A0J9YWF9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV2A0A0J9YWF9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV2A0A0J9YWF9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV2A0A0J9YWF9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV2A0A0J9YWF9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV2A0A0J9YWF9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV2A0A0J9YWF9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV2A0A0J9YWF9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV2A0A0J9YWF9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV2A0A0J9YWF9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV2A0A0J9YWF9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV2A0A0J9YWF9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV2A0A0J9YWF9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV2A0A0J9YWF9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV2A0A0J9YWF9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBV2A0A0J9YWF9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TRBV2A0A0J9YWF9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRBV2A0A0J9YWF9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRBV2A0A0J9YWF9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRBV2A0A0J9YWF9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRBV2A0A0J9YWF9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRBV2A0A0J9YWF9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRBV2A0A0J9YWF9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRBV2A0A0J9YWF9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRBV2A0A0J9YWF9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBV2A0A0J9YWF9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBV2A0A0J9YWF9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBV2A0A0J9YWF9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBV2A0A0J9YWF9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRBV2A0A0J9YWF9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRBV2A0A0J9YWF9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRBV2A0A0J9YWF9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRBV2A0A0J9YWF9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRBV2A0A0J9YWF9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRBV2A0A0J9YWF9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRBV2A0A0J9YWF9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRBV2A0A0J9YWF9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRBV2A0A0J9YWF9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRBV2A0A0J9YWF9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRBV2A0A0J9YWF9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRBV2A0A0J9YWF9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRBV2A0A0J9YWF9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRBV2A0A0J9YWF9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRBV2A0A0J9YWF9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRBV2A0A0J9YWF9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRBV2A0A0J9YWF9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRBV2A0A0J9YWF9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRBV2A0A0J9YWF9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRBV2A0A0J9YWF9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRBV2A0A0J9YWF9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRBV2A0A0J9YWF9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRBV2A0A0J9YWF9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV2A0A0J9YWF9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV2A0A0J9YWF9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBV2A0A0J9YWF9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBV2A0A0J9YWF9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBV2A0A0J9YWF9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBV2A0A0J9YWF9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBV2A0A0J9YWF9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRBV2A0A0J9YWF9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRBV2A0A0J9YWF9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRBV2A0A0J9YWF9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRBV2A0A0J9YWF9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRBV2A0A0J9YWF9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRBV2A0A0J9YWF9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV2A0A0J9YWF9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV2A0A0J9YWF9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV2A0A0J9YWF9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV2A0A0J9YWF9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV2A0A0J9YWF9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV2A0A0J9YWF9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBV2A0A0J9YWF9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBV2A0A0J9YWF9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBV2A0A0J9YWF9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBV2A0A0J9YWF9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBV2A0A0J9YWF9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBV2A0A0J9YWF9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBV2A0A0J9YWF9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBV2A0A0J9YWF9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBV2A0A0J9YWF9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBV2A0A0J9YWF9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBV2A0A0J9YWF9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBV2A0A0J9YWF9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBV2A0A0J9YWF9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBV2A0A0J9YWF9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBV2A0A0J9YWF9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBV2A0A0J9YWF9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBV2A0A0J9YWF9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBV2A0A0J9YWF9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRBV2A0A0J9YWF9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRBV2A0A0J9YWF9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRBV2A0A0J9YWF9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRBV2A0A0J9YWF9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRBV2A0A0J9YWF9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBV2A0A0J9YWF9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBV2A0A0J9YWF9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms