Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 AC011676.1-201ENST00000517658 397 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 CD3D-204ENST00000529594 422 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 SRSF5-204ENST00000553548 526 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 AL109628.2-201ENST00000554037 201 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM181A-AS1-201ENST00000554538 545 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01974-201ENST00000575126 494 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL25P-201ENST00000583862 260 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 Metazoa_SRP.189-201ENST00000614219 303 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR6876-201ENST00000622618 73 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM199X-202ENST00000493442 7457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC02504-201ENST00000512241 4949 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 CTNND1-237ENST00000534579 6024 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 TPX2-201ENST00000300403 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 GOLGA8A-202ENST00000432566 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 AP002490.1-201ENST00000502284 4233 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF185-202ENST00000318529 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ELF4-204ENST00000615377 3878 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 GCNA-202ENST00000373696 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 NOP2-223ENST00000620535 2791 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 HERC2P3-208ENST00000430598 4279 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 RAB27B-201ENST00000262094 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 NEPRO-202ENST00000383675 4672 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ALMS1-204ENST00000484298 12595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ALOX12P2-210ENST00000574727 4326 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 NLRC4-204ENST00000404025 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 TFIP11-204ENST00000407690 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 BSDC1-206ENST00000455895 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ZFHX3-203ENST00000397992 13841 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 EPHB2-204ENST00000400191 10816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 GAA-201ENST00000302262 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ABL2-211ENST00000512653 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 NUMB-212ENST00000554546 3607 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 PC-201ENST00000393955 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 CDK5RAP2-203ENST00000360822 5551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ATL3-201ENST00000398868 7135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 HAP1-201ENST00000310778 4087 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 TRPV1-202ENST00000399756 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC34A2-201ENST00000382051 4122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 C1orf226-203ENST00000458626 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 DAB2-217ENST00000545653 4537 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGEF9-218ENST00000624843 2154 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 MAP3K3-208ENST00000579585 3352 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 PLEKHB2-208ENST00000439822 4177 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 AC092447.8-201ENST00000566570 4162 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 CD44-201ENST00000263398 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 WDR91-201ENST00000354475 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 TSHR-203ENST00000541158 4566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 PLCG2-207ENST00000564138 8707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 SEPT8-210ENST00000448933 4270 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF45-201ENST00000269973 3898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 FER1L4-208ENST00000611673 3860 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP13A1-201ENST00000291503 3483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 POMGNT1-203ENST00000396420 3480 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 SUPT5H-215ENST00000599117 3902 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 SPATA13-201ENST00000343003 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP2A1-202ENST00000395503 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 RASGRP4-204ENST00000454404 3116 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 TG-208ENST00000519543 3132 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC12A3-205ENST00000566786 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 BUB3-203ENST00000368865 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 DLC1-201ENST00000276297 7447 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 CCDC129-205ENST00000451887 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 SPRED2-201ENST00000356388 4097 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 FBXO11-202ENST00000403359 4055 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ZBTB40-201ENST00000374651 8368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 SCD-201ENST00000370355 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC22A12-204ENST00000377574 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 KLF7-202ENST00000412414 7954 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF544-206ENST00000596652 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 AP3B2-201ENST00000261722 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 NELL1-211ENST00000532434 2400 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 KRBA1-207ENST00000496259 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.8 ms