Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK8-206ENST00000374189 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MROH1-211ENST00000544576 3673 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PDPR-210ENST00000568530 7223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PRRG1-201ENST00000378628 4493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SEZ6-204ENST00000442608 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 GBA-201ENST00000327247 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TREH-201ENST00000264029 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 LRTOMT-207ENST00000435085 3194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 BRF1-204ENST00000392557 3579 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AF121897.1-201ENST00000411867 3980 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNMA1-259ENST00000639406 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CARMN-210ENST00000602964 8398 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC44A2-202ENST00000407327 3301 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRG1-214ENST00000562558 3858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 BCAS3-202ENST00000407086 3496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNH6-201ENST00000314672 3062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 VIT-208ENST00000497382 2650 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TNXB-201ENST00000375244 13132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF4BP3-201ENST00000432132 1850 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRP1-210ENST00000572272 4422 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AMBRA1-202ENST00000458649 5351 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SV2C-202ENST00000502798 11035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SFXN2-201ENST00000369893 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 WSB1-201ENST00000262394 5139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 UBASH3A-201ENST00000291535 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC107983.2-201ENST00000425211 4735 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MUM1L1-201ENST00000337685 4308 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PLA2G4E-201ENST00000399518 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SCN5A-210ENST00000455624 7170 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PIGO-201ENST00000298004 2588 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AGBL3-203ENST00000436302 3533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 C3P1-201ENST00000495140 3526 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 C14orf119-201ENST00000319074 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RAPGEF3-201ENST00000389212 3294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC110079.1-201ENST00000567913 4395 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF259P1-202ENST00000572422 4912 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC25A24-202ENST00000370041 3404 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CSPG4P10-202ENST00000612093 3411 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ARID1B-230ENST00000637810 5073 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TP53BP1-201ENST00000263801 6346 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CDH11-202ENST00000394156 6874 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 APBA2-202ENST00000411764 3599 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 DENND2A-209ENST00000496613 3562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SNRNP200-201ENST00000323853 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 HIP1-204ENST00000434438 7066 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 C1orf127-201ENST00000377004 2761 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 KAT7-202ENST00000424009 3469 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 OGDH-201ENST00000222673 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PTGS1-206ENST00000614910 4894 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHGA11-203ENST00000622044 3633 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD27-201ENST00000306065 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP4A11-201ENST00000310638 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPV1-203ENST00000399759 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 GYS1-201ENST00000263276 3378 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CLIP3-201ENST00000360535 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CD22-205ENST00000544992 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA0895-202ENST00000317020 4241 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 NRG1-203ENST00000405005 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MYLK-205ENST00000360772 10027 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 QARS-201ENST00000306125 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SMPD4-201ENST00000351288 3661 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 HKDC1-201ENST00000354624 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 EPHB2-203ENST00000374632 3677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MRAS-201ENST00000289104 4538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 OTOG-202ENST00000399391 8778 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CHRM1-201ENST00000306960 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM47B-201ENST00000329357 2120 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP298-201ENST00000364991 111 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CNR1-202ENST00000369499 5549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TRBV6-5-201ENST00000390368 410 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC245036.2-201ENST00000433549 287 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms