Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I4

PCDHAC2, Protocadherin alpha-C2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHAC2Q9Y5I4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms