Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AFG3L2Q9Y4W6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AFG3L2Q9Y4W6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AFG3L2Q9Y4W6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AFG3L2Q9Y4W6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AFG3L2Q9Y4W6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AFG3L2Q9Y4W6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AFG3L2Q9Y4W6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AFG3L2Q9Y4W6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AFG3L2Q9Y4W6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFG3L2Q9Y4W6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFG3L2Q9Y4W6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFG3L2Q9Y4W6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFG3L2Q9Y4W6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFG3L2Q9Y4W6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFG3L2Q9Y4W6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFG3L2Q9Y4W6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFG3L2Q9Y4W6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFG3L2Q9Y4W6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFG3L2Q9Y4W6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFG3L2Q9Y4W6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFG3L2Q9Y4W6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFG3L2Q9Y4W6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFG3L2Q9Y4W6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFG3L2Q9Y4W6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFG3L2Q9Y4W6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFG3L2Q9Y4W6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFG3L2Q9Y4W6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFG3L2Q9Y4W6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFG3L2Q9Y4W6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFG3L2Q9Y4W6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AFG3L2Q9Y4W6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFG3L2Q9Y4W6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms