Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KNSTRNQ9Y448 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KNSTRNQ9Y448 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KNSTRNQ9Y448 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KNSTRNQ9Y448 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KNSTRNQ9Y448 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KNSTRNQ9Y448 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KNSTRNQ9Y448 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KNSTRNQ9Y448 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms