Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms