Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FARSAQ9Y285 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms