Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPSEQ9Y251 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPSEQ9Y251 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPSEQ9Y251 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPSEQ9Y251 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPSEQ9Y251 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPSEQ9Y251 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPSEQ9Y251 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPSEQ9Y251 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPSEQ9Y251 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPSEQ9Y251 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPSEQ9Y251 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPSEQ9Y251 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPSEQ9Y251 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPSEQ9Y251 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPSEQ9Y251 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPSEQ9Y251 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPSEQ9Y251 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPSEQ9Y251 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPSEQ9Y251 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPSEQ9Y251 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPSEQ9Y251 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPSEQ9Y251 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms