Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNX12Q9UMY4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX12Q9UMY4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms