Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms