Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DKK2Q9UBU2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms