Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL13Q9P2N7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms