Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RDH8Q9NYR8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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