Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms