Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK13-1Q9NX77 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms