Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPMQ9NSP4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms