Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF275Q9NSD4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms