Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZC3H12CQ9C0D7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZC3H12CQ9C0D7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms