Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM5Q9C035 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms