Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMES1Q9C002 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMES1Q9C002 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms