Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM8Q9BZR9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms