Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRNKL1Q9BZJ0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms