Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 FCF1-202ENST00000534938 794 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC078927.1-201ENST00000539652 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL031709.1-201ENST00000569831 435 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC002128.1-201ENST00000602262 1016 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 FRG2MP-201ENST00000613317 856 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 CNMD-201ENST00000377962 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 PTPN20-216ENST00000506080 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 AQP4-AS1-202ENST00000578701 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPP2R3C-213ENST00000555644 1347 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF506-202ENST00000450683 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 PSORS1C1-201ENST00000259881 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 EPGN-201ENST00000332112 847 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 MICU1-203ENST00000398763 1224 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL139220.1-201ENST00000436802 520 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL161646.1-201ENST00000447860 1013 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC074134.1-201ENST00000503901 1108 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01184-206ENST00000508878 968 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC139713.1-202ENST00000512366 460 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 ETFRF1-210ENST00000556927 833 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP001021.2-201ENST00000577935 544 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 GNG2-216ENST00000615906 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007671.1-201ENST00000616957 830 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01778-208ENST00000635288 1095 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 PSMA8-201ENST00000308268 1804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 DHFR-202ENST00000504396 1447 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 BLNK-203ENST00000413476 1599 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF559-211ENST00000592504 1398 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC117457.1-201ENST00000614557 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 APOBEC3G-201ENST00000407997 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-4Q9BYQ2 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms