Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCAPERQ9BY12 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms