Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms