Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC39A3Q9BRY0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms