Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms