Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms