Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
MMP19Q99542 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MMP19Q99542 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MMP19Q99542 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MMP19Q99542 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MMP19Q99542 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MMP19Q99542 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MMP19Q99542 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MMP19Q99542 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MMP19Q99542 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MMP19Q99542 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MMP19Q99542 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MMP19Q99542 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MMP19Q99542 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MMP19Q99542 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MMP19Q99542 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MMP19Q99542 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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