Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms